
作者:Wolfgang Becker、Cornelia Junghans、Axel Bergmann、Becker & Hickl GmbH,德国柏林
摘要:利用bh DCS-120共聚焦扫描荧光寿命成像系统记录燧石内层,我们发现了一些与古代细菌极为相似的圆形物体。这些物体大小约为20 µm,荧光衰减呈三指数曲线,其衰减分量分别为334 ps、2534 ps和7794 ps,振幅分别为0.5924、0.2534和0.1096。其荧光衰减与周围物质的衰减明显不同。这些物体通常成簇出现,分布在燧石内部的多个位置和不同深度。由于这些物体大小均匀,我们相信它们确实是微生物化石。
燧石的激光扫描荧光寿命成像

图1:燧石中的微生物化石。bh DCS-120共聚焦扫描荧光寿命成像系统,激发波长405 nm,检测波长435 nm至650 nm。图像尺寸400 x 400 µm。物镜20倍,NA=0.5,针孔尺寸1 AU(右)。SPCM数据采集软件的在线显示功能,衰减时间采用单指数近似。

图 2:包含物体(绿色)和周围材料(红色)的感兴趣区域中的荧光衰减曲线
SPC Image NG的荧光寿命分析
为了进一步了解这些神秘物体的荧光行为,我们对数据进行了 bh SPCImage NG FLIM 数据分析 [2]。图 3 展示了以此方式获得的寿命图像。从衰减参数和衰减曲线(右上和右下)可以看出,荧光衰减呈多指数衰减。从衰减曲线下方平滑的残差可以看出,三重指数模型可以很好地描述它。请注意,这些寿命与图 1 和图 2 中的不同。SPCM 使用一阶矩计算,得出寿命的单指数近似值,而 SPCImage 使用多指数模型进行 MLE 拟合,得出组分寿命的振幅加权平均值。两种方法获得的寿命必然不同。
图 3:SPCImage NG 生成的荧光寿命图像。左图:寿命图像,显示三指数拟合的振幅加权寿命 tm。MLE 拟合,GPU 计算。右上图:图像像素的 tm 直方图以及光标位置的衰减参数。右下图:光标位置的衰减曲线。图像格式为 512 x 512 像素,每个像素有 1024 个时间通道。
通过相量图进行图像分割

图4:通过相量图进行图像分割,选定具有细胞相量特征的像素。右下方显示选定像素的组合衰减曲线。
图5使用相同的程序来选择具有与细胞不同的相量特征的像素。组合衰减曲线显示在右下方。衰减分量分别为334 ps、2534 ps和7794 ps,振幅分别为0.5924、0.2534和0.1096。
图5:通过相量图进行图像分割,选定的像素与细胞的相量特征不同。右下方显示了选定像素的组合衰减曲线。
讨 论
燧石形成于中生代,距今约1.5亿至6000万年。人们认为,它是由富含硅的流体填充沉积物中的空腔(例如甲壳类动物或软体动物钻出的孔洞)而形成的。随着时间的推移,流体中的硅酸含量不断增加,胶凝化,最终凝固成隐晶质二氧化硅[5, 6]。可以想象,最初的流体中可能存在细菌。然而,硅化是一个缓慢的过程。目前尚不清楚细菌如何在日益恶劣的环境中存活如此长时间,或者至少在形态上保持完整。另一种可能性是,细菌在石头已经形成时就侵入其中。然而,我们的图像并未显示材料中可能存在裂缝或孔隙,而这些裂缝或孔隙正是细菌入侵的途径。总而言之,最有可能的解释是,我们看到的确实是中生代细菌的遗迹。如果这是正确的,那么使用激光扫描 FLIM 显微镜对燧石进行检查可能成为研究古代微生物的一种有趣的技术。
1. W. Becker, The bh TCSPC handbook. 10th edition (2023), available on www.becker-hickl.com
2. W. Becker, A.Bergmann, SPCIMage NG FLIM data Analysis. In: W. Becker, The bh TCSPC handbook. 10th edition (2023), available on www.becker-hickl.com
3. Becker & Hickl GmbH, DCS-120 Confocal and Multiphoton Scanning FLIM Systems, user handbook 9th ed. (2021). Available on www.becker-hickl.com
4. Y. Chmykh, J. L. Nadeau, The use of fluorescence lifetime imaging (FLIM) for in situ microbial detection in complex mineral substrates. J. Microsc. 294, 3651 (2024)
5. Flint.https://en.wikipedia.org/wiki/Flint
6. Flint and Chert. http://www.quartzpage.de/flint.html
Contact:
Wolfgang Becker
Becker & Hickl GmbH
Berlin, Germany, https://www.becker-hickl.com
Email: becker@becker-hickl.com
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